Bevor die Deutschen die St. Joseph Stiftung auf dem ehemaligen Anwesen 'Hohenheim' requirieren, fungiert das Gelände als Pflegeeinrichtung für katholische 'Geisteskrankenschwestern', die hier leben und - falls möglich - auch arbeiten. Es erhält den Namen 'Kriegslazarett 4/686' und ist neben dem in Arnhem eines der beiden offiziellen 'Kriegslazarette' in Gelderland. Im Gegensatz zu anderen deutschen Notkrankenhäusern werden hier auch chirurgische Eingriffe durchgeführt.

Nach dem gescheiterten Befreiungsversuch Operation Market Garden im September 1944 werden verwundete britische Fallschirmjäger zunächst im improvisierten Luftwaffen-Militärkrankenhaus in der König-Wilhelm-III-Kaserne in Apeldoorn versorgt. Als sie später als Kriegsgefangene in deutsche Lager gebracht werden, werden die verbleibenden Verwundeten in das Kriegslazarett an der Deventerstraat verlegt. Der britische Major Simon M. Frazer von einer medizinischen Einheit der britischen Armee darf bleiben, um die Verwundeten zu versorgen - er hat dies von der deutschen Führung erzwungen. Er tut dies zusammen mit fünf Krankenschwestern derselben Einheit: Fred Budd, Geoffrey Owen, Norman Mawditt, Phil Jackson und Parker.

Auch niederländische Zivilisten werden im Kriegslazarett behandelt. Widerstandskämpfer Johannes Arnoldus (Jan) van Bijnen - alias Frank - aus Oosterhout wird am 29. November 1944 während einer Befreiungsaktion von Widerstandskämpfern aus der König-Wilhelm-III.-Kaserne bei einem Feuergefecht mit den Deutschen schwer verwundet. Er stirbt kurz darauf am 1. Dezember 1944 an seinen Verletzungen. Der amerikanische Kopilot Ned Benedict droht am 14. Februar 1945 damit, seinen voll beladenen Bomber in Gebäude in Wormerveer, Nordholland, zu steuern, schafft es jedoch, ihn auf die Felder zu lenken. Ned und zwei seiner Besatzungsmitglieder werden wegen ihrer (Brand-)Verletzungen im Kriegslazarett in Apeldoorn behandelt. Ned erlebt die Befreiung im April 1945.

Einer der Patienten ist der Österreicher Hanns Albin Rauter, Leiter der SS und der Polizei in den Niederlanden. Südlich von Apeldoorn, in der Nähe des Weilers Woeste Hoeve, wird das Auto, in dem Rauter reist, in der Nacht zum 6. März 1945 mit zweihundert Kugeln durchsiebt. Sein Fahrer und Adjutant werden getötet, aber Rauter selbst überlebt den fehlgeschlagenen Angriff. Am nächsten Morgen um neun Uhr wird er schwer verletzt in das Kriegslazarett eingeliefert und erhält zwei Liter Blut, was sein Leben rettet. Als Vergeltungsmaßnahme werden einen Tag später 263 Männer hingerichtet, davon 117 in Woeste Hoeve.

Am 13. April 1945 befreien die Kanadier das Krankenhaus, nachdem sie zwei deutsche Scharfschützen ausgeschaltet haben. Sie finden 789 Patienten vor, darunter Kanadier, die bei früheren Kämpfen in Roermond und der deutschen Stadt Kleve verwundet wurden. Ein alliierter Offizier stellt das deutsche medizinische Personal ordentlich vor dem Gebäude auf und übergibt die Offiziere und Krankenschwestern den Kanadiern. Bald kommen etwa neunhundert Zivilisten zur Anlage, um Schutz vor dem Krieg zu suchen und ihre Wunden behandeln zu lassen. Am 14. April wird das Krankenhaus für einige Tage zum Hauptquartier der Kanadier, da Villa Laag Buurlo von einer deutschen Granate getroffen wurde. Am 28. April werden verwundete alliierte Soldaten nach Großbritannien transportiert.