Bereits zu Beginn des Krieges boykottierten einige Länder Pilsner Urquell als deutsches Produkt, weshalb die Exporte ausschließlich nach Deutschland gingen. Die Brauerei produzierte "schwaches Kriegsbier" und überlebte nur, weil sie die Arbeiter der Škoda-Werke mit Bier versorgte.

Während des Krieges wurden in jeder dieser Brauereien Schutzbauten errichtet, die als "Splitterschutzzelle" (Beobachtungstürme) oder "Einmannbunker" bezeichnet wurden. Als einfache Betonfertigteilzylinder mit schmalen Öffnungen gehörten sie wahrscheinlich zu den ersten vorgefertigten Festungsbauten. Sie boten keinen ausreichenden Schutz bei Luftangriffen, wurden aber als Beobachtungstürme für postierte Patrouillen genutzt.

Gegen Ende des Krieges wurde Pilsen bombardiert und beide Brauereien wurden stark beschädigt, während das Gambrinus fast vollständig zerstört wurde. Nach dem Ende der Bombardierung nutzten Feuerpatrouillen diese Beobachtungstürme, um die Ergebnisse des Luftangriffs zu überwachen und nicht explodierte Bomben zu lokalisieren.